绿皮火车在经过某些站点时会拉窗帘，主要是因为这些站点是军事保密区域或者是一些敏感地区，为保障国家安全和保密需要，车厢内的乘客被要求关闭窗帘，以避免外部环境对火车上的人员进行观察和拍摄，以防止信息泄露，确保国家安全。

同时，拉上窗帘还可以避免光线过强刺眼，给乘客带来一个更舒适的旅行环境。因此，拉上窗帘成为了绿皮火车保证旅客安全和保密的一项重要措施。