神木保障房只限本地人申请主要是为了满足当地群众对住房保障的需求。首先，限制只有本地人可以申请可以降低房屋空置率和投机炒房现象，保障房的真正受益者是本地经济弱势人群。

其次，对当地人实施住房保障政策可以促进当地经济稳定发展，增加当地居民的就业和收入水平，有利于社会公平和公正。

最后，对本地群众提供保障房也是当地政府履行社会责任的体现，有利于提升政府的形象和信誉。