在《神隐少女》中，紫月消失的原因是因为她被封印在了一个叫做“九幽魔窟”的地方。这个魔窟位于妖界的深处，是一个充满邪恶气息的地方，里面居住着许多凶恶的妖怪和恶魔。

据剧情介绍，紫月曾经是妖界的一位强大的魔神，但后来因为犯下了不可饶恕的罪行而被封印在了九幽魔窟之中。在那里，她经历了漫长的岁月，直到被主人公白小纯救出。

值得一提的是，紫月的消失也是故事情节的一个关键转折点。她的消失让主人公们不得不面对更加严峻的挑战和困难，而她的回归也为故事的后续发展带来了新的可能性。