在CNC系统中，调用存储卡程序的步骤如下：首先，将存储卡插入CNC系统中。然后，打开CNC系统中卡片管理系统，查询并选择需要调用的程序。接着，将所选程序加载到CNC系统的内存中，进行数控加工操作即可。在调用存储卡程序的过程中，需要注意选择正确的程序，并确保存储卡与CNC系统的连接正确可靠。在实际应用中，还需要根据具体的加工要求进行相关设置，以保证加工精度和质量。