萌小吖和萌娃娃的区别在于其指代的对象不同。

萌小吖多指一个具有萌属性的女性，通常是年轻的女性。

而萌娃娃则指一个可爱的婴儿或小孩子，通常是指女孩子。

这两个词语的使用场景也不同，萌小吖常常用于形容网恋对象或者是某位明星，而萌娃娃则常常用于家庭中形容可爱的小女孩。

总体而言，这两个词语虽然都带有一定的萌属性，但含义和使用场景却有所区别。