一般来说，规划红线是指在城市的规划中规定的建筑限界，如果别墅地下室没有计容，但有规划红线，意味着地下室已经包含在该别墅的总体规划中，也就是说该别墅地下室的建造并没有违法规划法规。

因此，只要这个别墅是依法依规建造的，持有相应的建筑工程竣工验收合格证明，就可以申请办理相应的产权手续。但具体还需根据当地相关政策法规进行具体细节处理。最好联系当地有关部门咨询具体办理流程。