小次郎的暴鲤龙在宝可梦的故事中确实是一个令人印象深刻的角色。至于它最后去了哪里，这个问题在动画和游戏中并没有明确的答案。

不过，我们可以从故事的情节和宝可梦世界的设定来推测一下。在故事中，暴鲤龙因为愤怒而攻击了火箭队和小智一行人，最终使他们漂流到了巨大宝可梦之岛。在那之后，故事并没有明确交代暴鲤龙的去向。

考虑到宝可梦世界的设定，宝可梦通常会有自己的栖息地和生态链。暴鲤龙作为一只强大的宝可梦，可能回到了适合自己的水域环境，继续它的生活。当然，也有可能因为与小次郎的缘分，它会在某个地方等待着小次郎的归来。

总的来说，暴鲤龙的具体去向是一个开放式的结局，留给观众和玩家们无尽的想象空间。无论它去了哪里，我们都希望它能过上平静而自由的生活。