亲子鉴定可分为个人隐私鉴定（仅用于自己知道是不是亲生关系），司法鉴定（用于上户口、移民、入学、打官司等司法用途），准备的材料各有不同。

个人亲子鉴定是不公开的，只是让鉴定委托人自己知道结果。

司法亲子鉴定是完全公开的，单亲鉴定必须鉴定委托人父、孩子二方同意，（双亲鉴定则委托人父、母、孩子三方同意）面对面同时到场，准好各类证件：身份证、军官证、护照、户口本以及孩子出生证等并且做好复印备用。由鉴定中心员工现场取样，有鉴定中心律师现场作证并开具证明需提供相关身份证件，所提供的资料必须真实性以及采样严格，需鉴定人员当面到场采集样本及身份验证。

DNA亲子鉴定采样基本原则：所有人体有细胞核的细胞都可以用来进行细胞核STR亲子鉴定；采样时所用器具以及操作，务必保证洁净。均需提供鉴定双方标本，常规样本包括血痕、毛发（带毛囊的头发）、口腔拭子（口腔黏膜细胞）。特殊样本包括烟头、羊水、指甲、口香糖、蜡块、牙刷、口杯、吸管、肌肉组织、经血、鼻血、纯精斑、胎儿流产物、混合精斑等。如血液、毛发，特殊如羊水，骨髓等标本。

血液，口腔粘膜，头发这是三种常规样本，也是目前DNA亲子鉴定当中使用最多的几种样本。亲子鉴定准确率和样本是没有直接关系，DNA鉴定的准确率只与检测的精度有关。比如采用更多检测位点的试剂盒，这样检测出来的结果的准确率也会更高。这几种不同样本的区别主要表现在：是否能够很方便而且成功的提取到DNA。一般来说血液和口腔粘膜这两种取样方法是最可靠的。