如果在京东自营店购买的苹果手机出现了两次的瑕疵或故障，建议先联系京东客服，提供相关订单号和瑕疵问题的照片或视频，寻求退换货或售后维修的解决方案。

如果京东自营店未能给予满意的服务，可以向消费者协会或相关法律部门投诉维权。同时，建议日常使用及维护手机，避免不必要的瑕疵和故障。