意思不同。
come with 与……一起供给;伴随……发生;从……开始。come in 进来;到达。
拓展:come down(下来;落),come along(来;随同),come to oneself(苏醒),come true(实现),come out(花开;发芽;出现;出来),come over(过来;顺便来访)