鱼亚甲基蓝杀菌的起效时间因使用情境和鱼类疾病的种类而有所不同。

一般来说，对于一般的鱼类烂身情况，使用亚甲基蓝进行治疗，大约一个星期左右就可以看到效果。这是因为亚甲基蓝具有一定的杀菌和消毒作用，可以有效地抑制细菌繁殖，缓解鱼类的烂身症状。

然而，对于特定的鱼类疾病，如鲤鱼水霉病或者无鳞鱼（鳗鲡科）的水霉病和烂尾病，使用亚甲基蓝的浓度和时间可能会有所不同。在这些情况下，一般建议使用2~3毫克/升的亚甲基蓝浓度，并连续使用3~4天，这样可以获得较好的治疗效果。

此外，对于倒刺鲃的水霉病，可以使用亚甲基蓝2毫克/升和食盐10毫克/升的混合溶液进行治疗。但请注意，使用时间和浓度应根据实际情况来确定，以达到最佳的治疗效果。

总的来说，鱼亚甲基蓝杀菌的起效时间取决于鱼类的疾病种类、亚甲基蓝的使用浓度以及治疗时间。在使用亚甲基蓝进行治疗时，建议根据具体的鱼类疾病和实际情况来确定使用浓度和时间，以获得最佳的治疗效果。同时，也应注意观察鱼类的反应和症状变化，及时调整治疗方案。