学生在学校自己磕伤，医保是可以报销的。法律依据：《中华人民共和国社会保险法》和《中华人民共和国民法典》，学生属于参保群体之一，享有基本医疗保险待遇。因此，学生在校内发生的意外伤害或突发疾病，可以通过医保报销部分医疗费用。