主要在于所包含的具体部门不同。政法机关指的是公、检、法、司、民、安、残、交等政法系统的机关。政法单位是各级党委领导下从事政法工作的专门力量，主要包括5类机关，分别是审判机关、检察机关、公安机关、国家安全机关、司法行政机关。前者包括后者，前者包含的部门多于后者。