扰乱医院秩序是一种违法行为，根据相关法律法规，处理扰乱医院秩序的方式主要有以下几种：

警告或罚款：对于扰乱医院秩序的行为，如果尚未造成严重损失，一般会被处以警告或罚款。具体的罚款数额根据情节的严重程度而定，通常在二百元以下。

拘留：如果扰乱医院秩序的行为情节较重，可能会被处以五日以上十日以下的拘留，并可以并处五百元以下的罚款。

追究刑事责任：如果聚众扰乱医院秩序，情节严重，致使医疗活动无法进行，造成严重损失的，首要分子可能会面临三年以上七年以下有期徒刑的刑事处罚，其他积极参与者也可能面临三年以下有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利的处罚。

在处理扰乱医院秩序的行为时，需要依据具体情况进行判断和处理。

同时，医院和相关部门也应该加强管理和监管，提高医疗服务质量，减少患者的不满和投诉，从而避免扰乱医院秩序的行为的发生。