法院冻结银行存款，区分两种情况来确定处理方式：

1、原告在起诉前或者诉讼过程中，申请法院采取财产保全措施，法院依法冻结被告的银行存款。这种情况下，被告可以提供相应的财产担保，由法院解除对银行存款的冻结。

2、被告拒不履行法院判决，法院在执行程序中依法冻结其银行存款。这种情况下，要先履行判决或者其他法律文书所确定的义务，然后才能申请法院解除冻结。