九月菊的根通常是圆柱形的，有的略微带有弯曲。它们通常生长在土壤的深层，为了吸收更多的水分和养分。根的表皮多为浅棕色或深棕色，有时会有纵向的皱纹或裂痕。切开后，九月菊的根的内部通常是白色的，有时会有淡淡的黄色或棕色。这些根在寒冷的环境中具有很强的耐寒能力，可以承受零下10度的低温而不会冻死。