二者的区别体现在以下几个方面：

种子与繁殖：被子植物具有种子，使用种子繁殖后代，这类植物又称为绿色开花植物，其种子外有果皮包被。而蕨类植物不结种子，用孢子繁殖后代，这包括藻类植物、苔藓植物和蕨类植物。

形态结构：蕨类植物通常具有根、茎、叶，体内有输导组织，一般比较高大。而被子植物的形态则更为复杂多样，包括乔木、灌木、藤本、草本等多种类型。

总的来说，被子植物和蕨类植物在繁殖方式和形态结构等方面存在显著的差异。这些差异使得这两类植物在生态系统中扮演着不同的角色，为生物多样性和生态平衡做出了重要贡献。