深圳网证通个人数字证书可以通过使用签名软件对需要签名的文件进行数字签名。

首先，需要在计算机上安装签名软件，并在其中导入自己的数字证书。

然后，打开需要签名的文件，在签名软件中选择使用自己的数字证书进行签名，并输入个人密码。

最后，签名软件会对文件进行加密并生成一个数字签名，证明文件的完整性和来源可信。通过这种方式，可以有效地保护文件的安全性和真实性。