云南苗族和重庆苗族都是中国苗族的一部分，他们在很多方面有着相似之处，比如语言、服饰、饮食、习俗等。但由于地域、历史、文化等方面的差异，他们也存在一些不同之处。

地域分布：云南苗族主要分布在云南省文山壮族苗族自治州、红河哈尼族彝族自治州、西双版纳傣族自治州等地区；而重庆苗族则主要分布在重庆市彭水苗族土家族自治县、酉阳土家族苗族自治县、秀山土家族苗族自治县等地区。

语言：虽然云南苗族和重庆苗族都属于苗族，但他们的语言可能存在一些差异。云南苗族使用的是滇东方言，而重庆苗族则使用的是川黔滇方言。

服饰：云南苗族和重庆苗族的服饰也存在一定的差异。云南苗族的服饰以刺绣、蜡染等工艺为主，色彩鲜艳、图案复杂；而重庆苗族的服饰则更加注重实用性和舒适性，色彩相对较为素雅。

习俗：由于地域和文化的差异，云南苗族和重庆苗族的习俗也有所不同。比如，云南苗族有一些独特的节日和庆典活动，如“火把节”、“花山节”等；而重庆苗族则有一些具有地方特色的民俗活动，如“赶苗会”、“踩山节”等。