小麦真菌和细菌是两种不同的微生物，它们的区别如下：

1. 结构差异：小麦真菌是单细胞真菌，其体积比细菌大得多；而细菌是原核生物，是由单一的细胞组成的。

2. 组成差异：小麦真菌的细胞壁主要由纤维素和几丁质构成，而细菌的细胞壁则主要由肽聚糖（如葡聚糖和穿孔素）构成。

3. 外形差异：小麦真菌通常有一个菌丝体或酵母体，而细菌则没有这样的结构。

4. 繁殖方式差异：小麦真菌通过孢子进行繁殖，而细菌则通过二分裂进行繁殖。

5. 生物功能差异：小麦真菌通常是真菌性病原体，可以感染人类和动物，导致多种疾病；而细菌则广泛存在于自然界中，包括一些有益的细菌，如肠道菌群中的益生菌。

综上所述，小麦真菌和细菌在体积、组成、外形、繁殖方式和生物功能等方面都有很大的差异。了解这些区别对于控制疾病和保护环境都非常重要。