公司可以制定明确的报销政策，规定员工可以凭合法有效的发票申请产前检查费津贴。具体操作可以由员工个人提交申请，附上发票和医生证明，经过部门领导审批后，由财务部门负责发放津贴。同时，公司也可以考虑设置最高报销金额限制和次数限制，以避免过度报销。